GCDH là một tetramer với đối xứng tứ diện, cho phép nó được xem như là một dime trong nhiều dime. Cấu trúc của nó rất giống với các ACD khác nhưng nếp gấp polypeptide tổng thể của GCDH được tạo thành từ ba miền: một miền amino-terminal bó alpha, một miền beta-sheet ở giữa và một miền alpha-xoắn khác ở cuối carboxyl. Flavin adenine dinucleotide (FAD) nằm ở điểm giao nhau giữa dải beta giữa và miền xoắn alpha-carboxyl của một tiểu đơn vị và miền carboxyl-terminal của tiểu đơn vị lân cận. Sự khác biệt rõ rệt nhất giữa GCDH và các ACD khác về cấu trúc là các vùng carboxyl và amino-terminal của monomer và trong vòng lặp giữa các chuỗi beta 4 và 5 bởi vì nó chỉ được tạo thành từ bốn dư lượng, trong khi các ACD khác có nhiều hơn. Túi chất kết dính được lấp đầy bằng một chuỗi ba phân tử nước, được chuyển đi khi chất nền liên kết với enzym. Các túi liên kết cũng nhỏ hơn một số túi ACD ràng buộc khác bởi vì nó chịu trách nhiệm về độ dài chuỗi cụ thể của GCDH cho chất nền thay thế.[4] Gen GCDH được ánh xạ vào 19p13.2 và có số lượng exon là 15.[5]